文件名称：cell_ranger：用于单个单元格数据的cell_ranger
文件大小：18KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-02 20:25:48
Nextflow
介绍 mpozuelo / MGI_demux是一种生物信息学分析管道，用于将i5和i7的Illumina数据多路分解。 工作流处理来自FastQ输入（ ， ）的原始数据以进行多路分解，有关结果的更多详细信息，请参见。 该管道是使用构建的， 是一种工作流工具，可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。 它带有docker容器，使安装变得简单，结果可高度重现。 快速开始 一世。 安装 ii。 安装 ， 或 iii。 开始运行您自己的分析！ 您需要按照“ working_directory / data / fastq / run_id / lane / run_id_lane_read {1,2} .fq.gz”的方式组织fastq文件。 然后从工作目录运行以下指令。 nextflow run mpozuelo/MGI_demux -profile < docker/s
【文件预览】：
cell_ranger-master
----conf()
--------base.config(1KB)
----Dockerfile(607B)
----nextflow.config(4KB)
----LICENSE(1KB)
----main.nf(10KB)
----environment.yml(293B)
----README.md(2KB)
----docs()
--------usage.md(10KB)
--------README.md(562B)
----bin()
--------scrape_software_versions.py(4KB)
--------modify_samplesheet.py(1KB)
--------convertHeaders.py(5KB)