文件名称：LUCIDus:新版本的LUCID
文件大小：4.95MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-19 10:10:17
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介绍 LUCIDus R软件包是一种集成工具，可通过多组学数据和表型特征获得对潜在或未知簇/子组的联合估计。 该软件包是Bioinformatics出版的研究论文“”中提出的新型统计方法的实现。 结合表型性状的多组学数据通过潜在聚类变量联合建模它们的关系而得到整合，这在下面的有向无环图（DAG）中得到了说明。 （来自的屏幕截图） 令G为一个乘以p的矩阵，其中各列代表遗传特征/环境暴露，而各行代表观察值； Z是标准化生物标志物的逐乘矩阵，Y是疾病结果的n维向量。 通过DAG图，进一步假设上述所有三个组成部分均由K类的类别潜在聚类变量X链接，并且在DAG隐含条件独立性的情况下，可以将LUCID模型的一般联合似然形式化为 其中Theta是代表与每个概率模型相关的参数的通用符号。 此外，我们假设X遵循G的多项式分布条件，Z遵循X的多元正态分布条件，Y遵循X的正态/伯努利（取决于疾病结果的