文件名称：blacktie:黑领带
文件大小：347KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-24 12:09:17
Python
欢迎来到黑领带！ 这个软件包是有功能的，但是正在大量开发中，因此您可能需要定期从git：//github.com/xguse/blacktie.git的仓库中获取最新代码。 对于最新版本，请拉'develop'分支。 我寻求合作和贡献，以改进此工具。 请接受并运行它，但是请把您的进步发送给我！ 它的目标是简化tophat / cufflinks工作流的所有输入/输出流到单个基于yaml的配置文件中的集成，并自动执行其他所有操作，以便一旦填写了配置文件，整个过程就完成了。只需一个命令即可运行多条件RNA-seq实验的分析。 文献资料 当前版本的文档可以在这里找到： : 问题跟踪 如果发现问题，错误或有功能要求，请转到此处提交： : 黑色领带海报 要感谢使用领带，请使用提供的DOI链接引用海报。 引入Blacktie：使用Tophat / Cufflinks / Cumme
【文件预览】：
blacktie-master
----MANIFEST.in(56B)
----README.rst(2KB)
----.gitmodules(97B)
----docs()
--------project.rst(4KB)
--------tutorial.rst(7KB)
--------conf.py(8KB)
--------make.bat(5KB)
--------_templates()
--------install.rst(3KB)
--------code.rst(343B)
--------_build()
--------Makefile(5KB)
--------index.rst(529B)
----bootstrap.py(3KB)
----NEWS.rst(2KB)
----src()
--------blacktie()
----requirements.txt(55B)
----examples()
--------qsub.template(2KB)
--------blacktie_config_example.yaml(8KB)
----setup.py(1KB)
----.gitignore(94B)
----test_data()
----HACKING.txt(411B)
----LICENSE.txt(34KB)
----buildout.cfg(206B)
----.hgignore(85B)