epipy:流行病学的Python工具

时间:2024-06-01 03:46:05
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文件名称:epipy:流行病学的Python工具

文件大小:529KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-01 03:46:05

Python

EpiPy 用于流行病学的Python软件包。 Epipy是用于流行病学的Python软件包。 它包含用于分析和可视化流行病学数据的工具。 Epipy目前可以产生: 分层汇总统计 案例树和棋盘图 曲线 按世代分析案例属性(例如性别) 2x2牌桌,赔率和相对风险 集群基本再现数的摘要 安装 Epipy的github版本比pip版本要远得多。 我建议尽可能从此存储库安装。 使用pip安装: pip install epipy 或克隆存储库并使用setup.py安装: git clone https://github.com/cmrivers/epipy.git cd ./epipy pip install -r requirements.txt python setup.py install EpiPy正在开发中。 请随时贡献。 如有任何问题,请通过或与我联系。 学习Pytho


【文件预览】:
epipy-master
----figs()
--------mers_casetree.png(77KB)
--------day_epicurve.png(28KB)
--------month_epicurve.png(32KB)
--------example_data_generation_hist.png(10KB)
--------generation_hist.png(18KB)
--------oddsratio_example.png(15KB)
--------rollingprop_example.png(13KB)
--------mers_sex_generation.png(15KB)
--------mers_generation_hist.png(23KB)
--------r0_hist.png(7KB)
--------example_casetree_health.png(77KB)
--------year_epicurve.png(17KB)
--------mers_r0_hist.png(14KB)
--------test_generation_hist.png(15KB)
--------steppe_exmple.png(19KB)
--------example_case_tree.png(75KB)
--------MERS_casetree.png(77KB)
--------test_checkerboard.png(40KB)
----epipy()
--------stripe_plot.py(2KB)
--------case_tree.py(5KB)
--------rolling_proportion.py(2KB)
--------test()
--------or_plot.py(2KB)
--------checkerboard.py(3KB)
--------basics.py(3KB)
--------__init__.py(988B)
--------analyses.py(15KB)
--------epicurve.py(2KB)
--------data_generator.py(2KB)
----docs()
--------FAQ.md(2KB)
--------examples_0.0.2.py(3KB)
--------examples_0.0.3.py(3KB)
----MANIFEST(379B)
----requirements-tdd.txt(30B)
----setup.cfg(40B)
----add_to_docs.txt(144B)
----requirements.txt(59B)
----setup.py(1KB)
----.gitignore(195B)
----README.md(2KB)

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