文件名称：ngopt:Illumina 序列数据的从头组装和分析-开源
文件大小：6.85MB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-19 14:29:55
开源软件
Illumina 序列数据的从头组装和分析，包括 A5 管道、A5-miseq、评估组装质量的工具，以及便于将数据提交到 NCBI 和 RAST 注释系统的脚本
【文件预览】：
a5_miseq_linux_20160825
----README.txt(10KB)
----bin()
--------vcfutils.pl(17KB)
--------GetInsertSize.jar(21KB)
--------idba_ud500(2.87MB)
--------fasta2agp.pl(5KB)
--------idba_ud(2.85MB)
--------trimmomatic.jar(116KB)
--------SSPACE()
--------bcftools(1.12MB)
--------bwa(1.97MB)
--------A5qc.jar(43KB)
--------samtools(1.47MB)
--------a5_pipeline.pl(60KB)
--------sga(3.79MB)
----example()
--------phiX.a5.final.scaffolds.fasta(5KB)
--------phiX.libs(48B)
--------phiX_p1.fastq(759KB)
--------phiX_p2.fastq(759KB)
----test.a5.sh(941B)
----adapter.fasta(1KB)