Transcriptome assembly ORA:基于参考的转录组重建软件-开源

时间:2024-05-20 13:42:11
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文件名称:Transcriptome assembly ORA:基于参考的转录组重建软件-开源

文件大小:134.99MB

文件格式:GZ

更新时间:2024-05-20 13:42:11

开源软件

用于基于参考的转录组重建的软件。 它从从RNA-seq获得的短读开始进行重建。 它最适合用于管理每个基因中内含子数量少的低等真核生物的转录组,也可用于检出蛋白。 它需要一个SAM文件,其读取与参考基因组对齐;(可选)一个gff文件,其基因在参考基因组上的位置。 它在输出中提供了已识别转录本的位置,转录本名称基于gff文件中存在的基因以及UTR区域的大小。


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