文件名称:算法实习基因拼接
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更新时间:2018-07-22 02:26:41
基因拼接
随着大量的基因组DNA序列数据被获得,它对了解基因越来越重要(基因组DNA的一部分,是负责合成蛋白质的)。总所周知,在基因组序列中,由于存在垃圾的DNA中断基因的编码区,真核生物(相对于原核生物)的基因链更加复杂。也就是说,一个基因被分成几个编码片段(称为外显子)。虽然在蛋白质的合成过程中,外显子的顺序是固定的,但是外显子的数量和长度可以是任意的。
大多数基因识别算法分为两步:第一步,寻找可能的外显子;第二步,通过寻找一条拥有尽可能多的外显子的基因链,尽可能大地拼接一个基因。这条链必须遵循外显子出现在基因组序列中的顺序。外显子i在外显子j的前面的条件是i的末尾必须在j开头的前面。
本题目的目标是,给定一组可能的外显子,找出一条拥有尽可能多的外显子链,拼接成一个基因。
输入:
给出几组输入实例。每个实例的开头是基因组序列中可能的外显子数n(0