idplot:将序列与共享的根参考序列进行比较

【文件属性】：
文件名称：idplot:将序列与共享的根参考序列进行比较
文件大小：959KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-05 06:26:36
virus nextflow plotly fasta recombination 将相似序列（* .fasta）与参考（.fasta）进行比较。 请参阅以下示例报告： : 设置 Nextflow用于运行管道。 它的安装说明，可以发现或通过安装的方式 。 Bioconda包括位于的完整设置指南。 安装完成并配置通道后，请运行： conda install nextflow 用法 使用nextflow执行工作流程： nextflow run brwnj/idplot -latest -with-docker \ --reference data/MN996532.fasta \ --fasta 'data/query_seqs/*.fasta' 通常只需几分钟即可完成，从而可以快速筛选局部序列相似性。 参数 参考序列（ --reference ）应该是仅包含一个序列的--reference 。 查询序列（ --fasta ）可以是单个序列文件，也

【文件预览】：
idplot-master
----.gitignore(26B)
----templates()
--------jsontofasta.py(1KB)
--------idplot.py(48KB)
----nextflow.config(1020B)
----data()
--------query_seqs()
--------MN996532.fasta(29KB)
--------img()
----LICENSE(1KB)
----main.nf(4KB)
----README.md(5KB)
----index.html(1.21MB)
----docker()
--------Dockerfile(351B)