文件名称：OccupancyModeling_Stan:在R中使用Stan进行站点占用建模
文件大小：427KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-13 13:10:29
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OccupancyModeling_Stan R中的Stan进行物种/站点占用建模 此处包含的代码模拟了一些物种/场所/重复项的存在/不存在数据，然后使用模拟的数据来估计占用建模参数。 Lahoz-Monfort等人（2016）将Royle＆Link（2006）占用模型框架应用于环境DNA。 在这里，我将其代码用于相关参数的贝叶斯估计，并将其从JAGS移植到Stan。 我还对它进行了概括，以适用于多个物种或每个物种多个站点。 欢迎发表评论，当然。 [Lahoz-Monfort，JoséJ.，Gurutzeta Guillera-Arroita和Reid Tingley。 “用于统计环境DNA样本中假阳性错误的统计方法。” 分子生态资源16.3（2016）：673-685。] 我还包括了一个单一物种的演示（Rmd文件和随附HTML），它演示了占用模型的逻辑，并为一个假设的案例拟合了
【文件预览】：
OccupancyModeling_Stan-master
----SOM_Hierarchical_Rstan.R(5KB)
----SOM_Explained.html(950KB)
----SOM_Explained.Rmd(9KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(1005B)
----Stan_SOM_demo.stan(1KB)