文件名称：ngs-main-wes:这是dockerize的“体细胞配对WES（Normal-Tumor）管道”，它是指GATK最佳做法
文件大小：442KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-18 19:05:42
docker python3 bioinformatics-pipeline ngs-pipeline Python
ngs-main-wes 这是Docker化的“体细胞配对WES（Normal-Tumor）hg19管道”，是指GATK最佳做法。 注意：此脚本基于相关路径 流程图 准备环境： git clone到您的主项目目录（例如OSCC） 将“ ngs-main-wes.py”和“ NGStools.py”放入您的主项目目录（例如OSCC） 在子项目目录中准备自己的原始数据（例如66xWES） 用法： python3 ngs - main - wes . py 可定制： 标签：wes_v3（docker image： ://hub.docker.com/r/adgh456/ngs-main/） 基因组座标：ucsc.hg19.fasta dbSNP：dbsnp_138.hg19.vcf COSMIC：CosmicAllMutsHeaderSorted.vcf seq_bed：
【文件预览】：
ngs-main-wes-master
----NGStools.py(21KB)
----ngs-main-wes_Guide.png(235KB)
----.gitignore(1KB)
----README.md(3KB)
----Guide.png(235KB)
----ngs-main-wes.py(4KB)