【文件属性】：
文件名称：GATK-pipeline:实现 GATK 管道以进行变体调用的 shell 脚本
文件大小：120KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-07-10 08:42:01
Shell
GATK-管道
实现 GATK 管道以进行变体调用的 shell 脚本。 为示例 BAM 文件创建文件。 通过在一组样本上运行脚本创建的 GVCF 文件可以使用联合进行基因分型
从下载GATK
关于 GATK 的信息-
依赖关系
用法
sh GATK.sh
输出
file_name_output.raw.snps.indels.g.vcf
GATK.pdf 包含 GATK-HaplotypeCaller 背后的数学解释。
【文件预览】：
GATK-pipeline-master
----README.md(949B)
----License.txt(1KB)
----GATK.pdf(117KB)
----GATK.sh(6KB)