GATK-pipeline:实现 GATK 管道以进行变体调用的 shell 脚本

时间:2024-07-30 02:28:41
【文件属性】:

文件名称:GATK-pipeline:实现 GATK 管道以进行变体调用的 shell 脚本

文件大小:120KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-30 02:28:41

Shell

GATK-管道 实现 GATK 管道以进行变体调用的 shell 脚本。 为示例 BAM 文件创建文件。 通过在一组样本上运行脚本创建的 GVCF 文件可以使用联合进行基因分型 从下载GATK 关于 GATK 的信息- 依赖关系 用法 sh GATK.sh 输出 file_name_output.raw.snps.indels.g.vcf GATK.pdf 包含 GATK-HaplotypeCaller 背后的数学解释。


【文件预览】:
GATK-pipeline-master
----README.md(949B)
----License.txt(1KB)
----GATK.pdf(117KB)
----GATK.sh(6KB)

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