uparse_python:**已弃用** Uparse python 脚本的python 包**已弃用**

时间:2024-08-10 00:54:45
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文件名称:uparse_python:**已弃用** Uparse python 脚本的python 包**已弃用**

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更新时间:2024-08-10 00:54:45

Python

为便于使用而打包的 Uparse python 脚本 uparse/usearch 带有一组可选的。 这个包结合了这些脚本并使它们在系统范围内可用,希望减少文件系统的混乱并提高可重复性。 uparse_fasta_number.py --fasta fastafile --prefix "awesome_experiment" > fastafile uparse_fastq_strip_barcode_relabel_py --fastq fastqfile --primer "ACCTTAC" --barcodefilename barcodes.txt --labelprefix "my_label" > output uparse_faqual2fastq.py --fasta fastafile --qual qualfile > output uparse_uc2otu


【文件预览】:
uparse_python-master
----uparse_python()
--------faqual2fastq.py(1KB)
--------uc2otutab.py(1KB)
--------revcomp_lib.py(1KB)
--------faqual2fastq2.py(2KB)
--------primer.py(4KB)
--------die.py(446B)
--------fastq_strip_barcode_relabel2.py(2KB)
--------__init__.py(0B)
--------fastq.py(3KB)
--------progress.py(1KB)
--------fasta.py(5KB)
--------fasta_number.py(1020B)
--------fastq_strip_barcode_relabel.py(2KB)
--------uc.py(3KB)
----Readme.md(979B)
----setup.py(1KB)

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