文件名称：CLEAR:直接比较环状和线性RNA表达
文件大小：54.77MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-16 10:56:57
Python
清除/ CIRCexplorer3 对于C ircular和L A的计算管道inear RNAêXPRESSION甲来自R ibosomal-RNA耗尽（R ibo-）RNA-SEQ nalysis（CLEAR / CIRCexplorer3） 架构图 安装要求 软件 （> = 2.3.6） （> = 2.0.5） （> 1.3.6） 软件包（python 2.7 +） （> = 0.8.4） 安装 git clone https://github.com/YangLab/CLEAR cd CLEAR python ./setup.py install 用法 从fastq文件开始： usage: clear_quant [-h] -1 M1 [-2 M2] -g GENOME -i HISAT -j BOWTIE1 -G GTF [-o
【文件预览】：
CLEAR-master
----src()
--------spReads.py(8KB)
--------run.py(10KB)
--------__init__.py(0B)
--------version.py(22B)
--------circ_quant.py(11KB)
----test()
--------test_data.tar.gz(54.78MB)
----setup.py(1KB)
----README.md(5KB)
----docs()
--------._pipeline.png(4KB)
--------pipeline.png(115KB)
----.gitignore(2KB)