文件名称：RNASeqTool比较：数据科学高级项目：比较RNA测序工具
文件大小：74.6MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-02-29 07:31:58
JupyterNotebook
RNASeqTool比较
数据科学高级Capstone项目：比较RNA测序差异基因表达分析工具
在这个项目中，我们想在使用不同数量的差异表达基因创建的模拟数据上比较不同的差异基因表达分析工具。
运行项目
使用命令launch.sh -i buijoseph21/rna-seq-tool-comparison:v1 -m 6来获取来自compcodeR的必要软件（例如， generateSyntheticData ， runDiffExp ， ABSSeq ， PoissonSeq等）以生成综合数据并进行差异基因表达分析。 -m 6指定运行需要更多内存的工具所需的RAM数量。
使用run.py构建项目
使用命令python run.py build来生成data/data