文件名称:matlab阻滞增长模型代码-MCS_growth-coupling:用于计算不同增长耦合度的MCS的脚本
文件大小:331KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 20:20:45
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matlab阻滞增长模型代码计算基因敲除策略(MCS),用于不同程度的增长耦合生产 补充代码: 系统化增长耦合产品合成的不同概念和用于计算相应菌株设计的单一框架 Philipp Schneider,Radhakrishnan Mahadevan,Steffen Klamt 2021/03/16 通讯作者: 新增功能( CellNetAnalyzer ): 的最优约束定义(R I = R I,最大值)用于描述期望的和不期望的行为(除静电线性形式为T [R≤T和d - [R≤d的约束)。 这样的约束条件可用于定义潜在的和弱耦合的产品合成的MCS设置。 对于潜在的增长耦合生产,人们将期望的通量状态定义为最佳增长状态,并且对于可达到的增长速度和产品合成速度符合最小要求。 对于弱增长耦合的产品合成,一个目标系统将增长最优性与静态约束r_P = 0组合在一起。MCS将寻求消除最大增长与零产量重合的磁通状态。 软件要求: MATLAB2016b:registered:或更高版本 IBMILOG:registered:CPLEX:registered:12.7、12.8、12.9或12.10(请确保使用兼容的CPLEX:registered:和MATLAB:registered:版本。建议使用版本12.10。