文件名称：matlab2018b运行代码-FaceCat:脸猫
文件大小：21.58MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-09 08:00:40
系统开源
matlab2018b运行代码脸猫 一种从鼠标面部的视频记录中对运动行为进行分类的工具。 有关详细信息，请参阅和2020-03-08_Master_Thesis_Wiessalla.pdf 。 分水岭聚类算法的所有步骤均来自Berman 等人。 2014 年“绘制*移动果蝇的刻板行为” ：，。 HOG 生成参数和代码逻辑遵循Dolensek 等人。 2020 年“小鼠情绪状态的面部表情及其神经元相关性” ：。 可以找到他们的 GitHub 存储库，但完整代码仅在 zenodo 上。 安装 只需将存储库克隆到您选择的目的地并从那里运行它。 您需要 MATLAB2018b 才能运行。 代码依赖于以下软件包：Image Processing Toolbox 11.1、Statistics and Machine LearningToolbox 11.7、Computer Vision Toolbox 9.2、Parallel Computing Toolbox 7.2、MATLABParallel Server 7.2。 视频的测试文件类型是 *.mp4。 跑步 调用processWrap
【文件预览】：
FaceCat-main
----2020-03-08_Master_Thesis_Wiessalla.pdf(22.72MB)
----.gitignore(51B)
----processWrapper.m(2KB)
----optimizeMotE.m(2KB)
----README.org(2KB)
----LICENSE.md(34KB)
----legacy()
--------A_2020-04-07_extract_laser_pattern.ijm(485B)
--------D_checkSequentiality.m(739B)
--------backup_MP4.m(1011B)
--------E2_randForest.m(2KB)
--------B_processMP4_1.m(2KB)
--------batchExtractHOG_par.m(4KB)
--------detectClusterChanges.m(320B)
--------mp4_2avi.m(445B)
--------README.txt(126B)
--------E_randForest.m(2KB)
--------extractHOG_par.m(3KB)
--------crop_and_separate.m(1KB)
--------subsetPdist.m(672B)
--------extractHOG.m(3KB)
--------C_clusterDistances.m(726B)
----postAnalysis()
--------patMat.m(299B)
--------clusterEstimateWrapper.m(907B)
--------detectClusterChangesStep.m(478B)
--------overlapCount.m(163B)
--------visualInspection.m(1KB)
--------completePostAnalysis.m(2KB)
--------visualizeClustering.m(961B)
--------optimizeRandFor.m(1KB)
--------bootDist.m(596B)
--------subsetPdist.m(659B)
--------helperPost.m(494B)
--------detectPatterns.m(4KB)
--------removeDuplicatePatterns.m(903B)
----utils()
--------alignSamplingRates.m(430B)
--------processWrapper.m(1KB)
--------customWait.m(341B)
--------extractStereotyped.m(263B)
--------thresholdDuration.m(863B)
--------clickCallback.m(191B)
--------separateVideo.m(653B)
--------downsampleCluster.m(212B)
--------extractRecordedFramesIdcs.m(1KB)
--------uiDrawRois.m(882B)
--------postClusterEstimate.m(1KB)
--------boot.m(1KB)
--------detectClusterChanges.m(320B)
--------clusterEstimate.m(454B)
--------stitchThresholdHoles.m(939B)
--------extract_stat_tables.m(705B)
--------grayCrop.m(272B)
--------measureGrayValue.m(703B)
----HOG()
--------batchExtractHOG_concat.m(2KB)
----watershedClustering()
--------inv_watershed.m(176B)
--------watershedClustering.m(332B)
--------findPointDensity.m(1KB)
--------make_density_plots.m(531B)