文件名称：SegmentationLoader:将WSI细分加载到mongodb实例
文件大小：17KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-15 00:07:28
Python
SegmentationLoader 将WSI分段加载到Docker网络环境（即QuIP）中的mongodb实例。 设置 资料夹结构 参见。 ./data的目录结构： ├── data/ │ ├── segmentation_results/ | ├── manifest.csv │ ├── TCGA-A2-A3XZ-01Z-00-DX1.svs/ (folder) | ├── ...lots of segmented files | 清单文件将与包含以下文件的目录处于同一级别 清单文件 细分数据是每张幻灯片一个文件夹。 因此，在文件中，您可能具有例如： segmentdir,studyid,clinicaltrialsubjectid,imageid TCGA-A2-A3XZ-01Z-00-DX1.svs,TCGA-A2-A3XZ-
【文件预览】：
SegmentationLoader-master
----Dockerfile(683B)
----LICENSE(2KB)
----README.md(2KB)
----data()
--------segmentation_results()
----archive()
--------quip_csv-1.py(10KB)
--------pathdbapi-1.py(2KB)
----docker-compose.yml(267B)
----.gitignore(91B)
----app()
--------quip_csv.py(10KB)
--------quipup.py(5KB)
--------requirements.txt(25B)
--------quipdb.py(3KB)
--------quipargs.py(1KB)
--------loadfiles.sh(1KB)
--------pathdbapi.py(3KB)