Measure_ROIs:ImageJ宏

时间:2024-05-28 05:25:34
【文件属性】:

文件名称:Measure_ROIs:ImageJ宏

文件大小:29KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-28 05:25:34

JavaScript

设置了“测量投资回报率”宏 •这组宏用于定义图像上的关注区域并测量其特征(区域,强度...)。 工作流程分为两部分。 它允许您通过三种不同的方法为给定通道上的所有图像生成感兴趣的特征的归类ROI。 “分类”是指您可以为ROI分配类别(树突,轴突,转染,未转染...)。 这部分的输出是RoiSets,即作为.zip文件的ROI集合,可以在ImageJ ROI管理器中打开它们,并通过将它们拖放到ImageJ工具栏上将其分配给当前活动的堆栈。 ROI是在给定的通道上生成的(用于AIS的标记,map2染色...)。 可以在此通道上执行测量,也可以通过打开另一个单通道堆栈上的ROI在同一实验的其他通道上执行。 您可以使用NeuronJ半自动沿着神经突生成线迹。 这使用前三个宏完成:“生成跟踪文件夹”,“启动NeuronJ”和“将NDF转换为ROI”。 您可以使用标准ImageJ工具(矩形,圆形


【文件预览】:
Measure_ROIs-master
----Measure ROIs.ijm(8KB)
----Calculate_by_Image.ijm(6KB)
----Measure_Intensities.ijm(3KB)
----Calculate_Ratios.ijm(7KB)
----README.md(2KB)
----Pro_Feat_Fit.js(62KB)
----Generate_Tracings_Folder.ijm(3KB)
----Convert_ndf_to_ROI.ijm(10KB)
----Edit_Cat_ROIs.ijm(4KB)

网友评论

  • 请问有neuronJ的吗