imagej_processing:用于 ImageJ(无头)宏处理和 SLURM 脚本的演示文件 Office HoursTips at 12

时间:2024-07-13 21:24:55
【文件属性】:

文件名称:imagej_processing:用于 ImageJ(无头)宏处理和 SLURM 脚本的演示文件 Office HoursTips at 12

文件大小:58.4MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-13 21:24:55

Shell

imagej_processing ImageJ(无头)宏处理和 SLURM 脚本的演示文件,用于办公时间/12 点提示 在 Odyssey 上使用 ImageJ 进行图像处理和自动化 Bob Freeman, PhD robertfreeman [at] g.harvard.edu 启动交互式 NoMachineX 会话以进行图像处理安装 NoMachineX 客户端启动客户端和登录抓取交互式会话启动斐济 做一个简单的处理步骤 打开图像 > 调整 > 大小 运行插件或宏 录制用于重复处理的宏插件 > 宏 > 录制 现在执行必要的步骤 处理整个文件夹 New > Script > Template copy/paste 在宏步骤中调整名称/路径硬编码的位置 将该宏转换为命令行驱动的 sbatch 脚本模板宏文件插入 process_folder_resize 代码并调整切换到调试模式切


【文件预览】:
imagej_processing-master
----macros()
--------process_folder_resize.headless.ijm(3KB)
--------process_folder_resize.template.headless.ijm(2KB)
--------Process_Folder_resize.ijm(874B)
--------Downsize.ijm(269B)
--------batch_resize.txt(62B)
----process_folder_resize_pid32995899.out(0B)
----sample-images.zip(44.61MB)
----process_folder_resize_pid32995899.err(1KB)
----samples()
--------batchout()
--------AuPbSn40.jpg(141KB)
--------flybrain.zip(1000KB)
--------batchin()
--------flybrain_resized.tif(2.68MB)
----README.md(2KB)
----slurm()
--------process_folder_resize.template.headless.slurm(3KB)
--------process_folder_resize.headless.slurm(3KB)
----macro_parameters.txt(252B)

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