模块:Nextflow工作流程的模块文件

时间:2021-02-22 07:19:11
【文件属性】:
文件名称:模块:Nextflow工作流程的模块文件
文件大小:14KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-22 07:19:11
Nextflow 模组 SAGC Nextflow管道中使用的Nextflow模块。 编码准则 这些指南改编自 。 有关使用以下准则的过程模板,请参见utils / template.nf。 使用此存储库的Tool / version / Command.nf文件夹结构。 使用原始工具版本编号 使用CamelCase作为工具,命令和进程的名称 对于参数,输入,输出和脚本,请使用小写字母,并用下划线分隔单词。 每个缩进级别使用4个空格。 所有输入和输出标识符都应反映其概念上的身份。 使用诸如unaligned_sequences,reference_genome,系统发育或aligned_sequences之类的信息性名称,而不要使用foo_input,foo_file,结果,输入,输出等。 为每个进程定义两个标签,其中包含工具名,版本和命令,并用下划线分隔。 BWA_0.7.17 BWA_0
【文件预览】:
modules-main
----STAR()
--------2.7.3a()
----umi_tools()
--------1.0.0()
----salmon()
--------1.3.0()
----bcl2fastq()
--------2.20.0.422()
----sambamba()
--------0.8.0()
----LICENSE(1KB)
----gatk()
--------4.1.9()
----README.md(2KB)
----arriba()
--------2.1.0()
----fastp()
--------0.20.1()
----STARFusion()
--------1.9.1()
----fastqc()
--------0.11.9()
----subRead()
--------2.0.1()
----bwa()
--------0.7.17()

网友评论