文件名称：anndata2ri:在 AnnData 和 SingleCellExperiment 之间转换
文件大小：35KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 23:34:24
jupyter bioconductor single-cell rpy2 scanpy
AnnData ↭ SingleCellExperiment 从到并返回的 RPy2 转换器。 （有关转换的详细信息，请参阅） 例如，您可以使用它来使用和处理您的数据，如本 安装 pip install anndata2ri # or conda install -c bioconda anndata2ri 故障排除 如果您在安装或导入 anndata2ri 时遇到问题，请确保您首先： 检查堆栈跟踪：如果在安装或导入依赖项（例如rpy2 ）时发生错误，请在该项目的错误跟踪器中报告您的问题。 搜索问题。 在撰写本文时，29 个错误中有 17 个 (60%) 无效或 rpy2 错误/安装问题。 确保你有一个兼容的 R 版本：rpy2 需要 R ≥ 3.6。 来自 Python 的用法 要么手动使用转换器…… import anndata2ri from rpy2 . robj
【文件预览】：
anndata2ri-master
----.travis.yml(1KB)
----README.rst(3KB)
----.readthedocs.yml(168B)
----pyproject.toml(1KB)
----docs()
--------conf.py(3KB)
--------ext()
--------Makefile(307B)
--------index.rst(154B)
--------_static()
----anndata2ri()
--------test_utils.py(3KB)
--------rpy2_ext.py(509B)
--------r2py.py(4KB)
--------conv_name.py(836B)
--------scipy2ri()
--------__init__.py(2KB)
--------py2r.py(3KB)
--------conv.py(1KB)
----pytest.ini(824B)
----tests()
--------test_scipy_rpy2py.py(3KB)
--------test_py2rpy.py(2KB)
--------test_rpy2py.py(3KB)
--------test_scipy_py2rpy.py(1KB)
----LICENSE(32KB)
----.gitignore(108B)
----demo.ipynb(3KB)