文件名称：Heatmap-Volcano-Manhattan-plotplot-in-Python:Python中的热图，用于基因表达数据
文件大小：1.34MB
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更新时间：2024-05-06 16:05:10
JupyterNotebook
Python中的热图，火山和曼哈顿图 什么是热图？ 连续的颜色图，其中每种颜色代表一组特定的值。这是可视化和识别来自不同治疗条件的数百至数千个基因之间具有统计学意义的重要基因表达变化的好方法 什么是火山图？ 火山图是具有类似火山形状的二维（2D）散点图。 在对数倍数变化（X轴）和p值（Y轴）方面，用于可视化和识别来自两个不同实验条件（例如，正常与治疗）的统计学上显着的基因表达变化的火山图。 什么是曼哈顿地块？ 曼哈顿图用来将SNP与给定的性状或疾病的关联可视化为具有统计学意义的基因组尺度上的p值。 在曼哈顿图中，X轴和Y轴代表染色体上的SNP以及相关的p值-log10 [p]。 这是在基因组规模上可视化数千到数百万个SNP的好方法。 p值最低（-log10 [p]较高），最高是给定SNP与性状或疾病的关联。 曼哈顿图还可用于显示具有Fst值的SNP标记（遗传分化量度）。
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Heatmap-Volcano-Manhattan-plotplot-in-Python-main
----Correlation_analysis_in_Python.ipynb(56KB)
----Heatmap_and_Volcano_plot_in_Pythonin_Python.ipynb(623KB)
----Heatmap_in_Python.ipynb(112KB)
----Heatmap_and_Volcano_and_Manhattan_plotplot_in_Python.ipynb(1.1MB)
----README.md(1KB)