R-Bioinformatics-Cookbook:Packt出版的《 R生物信息学食谱》

时间:2024-06-13 02:57:05
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更新时间:2024-06-13 02:57:05

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R生物信息学食谱 这是Packt出版的的代码库。 使用R和Bioconductor进行RNAseq,基因组学,数据可视化和生物信息学分析 这本书是关于什么的? 在《 R生物信息学食谱》中,您会遇到生物信息学领域中常见且不太常见的挑战,并使用实际示例解决这些挑战。 该书指导您完成从原始数据到干净结果的各种生物信息学分析。 它显示了如何导入,浏览和评估数据以及如何报告数据。 本书涵盖以下激动人心的功能: 使用Bioconductor确定RNAseq数据中的差异表达 运行SAMtools并开发管道以查找单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失 使用ggplot创建和注释一系列可视化 使用Ensembl查询外部数据库以查找功能基因组学信息 使用DECIPHER执行大规模多序列比对以执行比较基因组学 使用d3.js和Plotly创建动态和交互式Web图形 使用k最近邻,支持向量机和随机森林来查找


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