文件名称:tif转rawmatlab代码-CaMKII-single-molecule:CaMKII单分子
文件大小:6.51MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-16 00:16:39
系统开源
tif转原始Matlab代码CaMKII单分子 自述文件,用于Matlab代码和分析 在您选择的文件夹中获取所有.tif格式的原始图像文件。 使用ImageJ中的虚拟堆栈生成成对的合成图像(488:560通道或488:640通道)。 使用代码CAMKII_ImageJ_Preprocessing_Duplication_v2_TwoChannel_WOBlank.m来重建重复图像,以便在ImageJ的TrackMate模块中进行跟踪(有关详细信息,请查看代码注释)。 这些应写出文件Tirf488.tif(用于488通道)和Tirf560.tif(用于560通道)。 请注意,如果您有488:640复合对,则输出文件仍称为Tirf488.tif和Tirf560.tif,其中Tirf560.tif表示640通道的数据。 使用ImageJ中的单个粒子跟踪插件TrackMate通过分析这些文件(Tirf488.tif和Tirf560.tif)来检测单个单个粒子(Jaqaman等人,2008)。 这些将为每个单个粒子生成点和跟踪统计信息,并以.csv文件的形式写出。 将频道名称附加到这些.csv中
【文件预览】:
CaMKII-single-molecule-master
----find_coloc_plot_intensity.m(4KB)
----Spots in tracks statistics560.csv(9.47MB)
----getChannelData.m(2KB)
----Spots in tracks statistics488.csv(9.77MB)
----getIntensities.m(565B)
----LICENSE(1KB)
----readtext.m(20KB)
----README.md(1KB)
----Track statistics560.csv(4.24MB)
----CAMKII_ImageJ_Pretreatment_Duplication_v2_TwoChannel_WOBlank.m(2KB)
----findColocalization.m(5KB)
----plotIntensities.m(505B)
----getColocalizationCounts.m(466B)
----Track statistics488.csv(4.28MB)