文件名称:BWA算法源代码
文件大小:262KB
文件格式:ZIP
更新时间:2022-04-28 18:07:16
序列比对
生物基因的序列比对算法,包含了以下3种算法: 1.BWA-backtrack 2.BWA-SW 3.BWA-MEM
【文件预览】:
bwa-master
----kbtree.h(16KB)
----fastmap.c(19KB)
----bwape.c(29KB)
----rle.c(5KB)
----malloc_wrap.h(1KB)
----bwt_gen.c(53KB)
----bntseq.h(3KB)
----kseq.h(9KB)
----khash.h(20KB)
----utils.c(7KB)
----bntseq.c(14KB)
----kstring.c(703B)
----bwamem_extra.c(4KB)
----ksort.h(9KB)
----bwtaln.h(4KB)
----COPYING(34KB)
----bwtgap.c(9KB)
----example.c(2KB)
----NEWS.md(39KB)
----bwa.c(14KB)
----bwamem.c(47KB)
----rle.h(2KB)
----bwtsw2_chain.c(3KB)
----QSufSort.c(12KB)
----bwa.h(2KB)
----bwtsw2_aux.c(24KB)
----bwakit()
--------run-gen-ref(2KB)
--------run-bwamem(7KB)
--------typeHLA-selctg.js(2KB)
--------bwa-postalt.js(18KB)
--------README.md(6KB)
--------run-HLA(411B)
--------typeHLA.js(16KB)
--------typeHLA.sh(1KB)
----malloc_wrap.c(1KB)
----bwtsw2_core.c(19KB)
----bwt_lite.h(653B)
----bwamem_pair.c(17KB)
----bwt.c(15KB)
----bwase.h(1KB)
----kvec.h(3KB)
----bwashm.c(6KB)
----bwtindex.c(10KB)
----bwa.1(27KB)
----bamlite.h(3KB)
----.travis.yml(53B)
----kstring.h(2KB)
----rope.c(9KB)
----README-alt.md(9KB)
----bwt_lite.c(3KB)
----bwaseqio.c(7KB)
----kopen.c(9KB)
----maxk.c(2KB)
----pemerge.c(9KB)
----README.md(9KB)
----qualfa2fq.pl(617B)
----bwt.h(5KB)
----Makefile(3KB)
----ksw.h(5KB)
----xa2multi.pl(731B)
----utils.h(4KB)
----bwtsw2_main.c(4KB)
----bwamem.h(8KB)
----ksw.c(26KB)
----bwtsw2_pair.c(10KB)
----.gitignore(55B)
----kthread.c(4KB)
----bwtgap.h(996B)
----bwtsw2.h(1KB)
----bamlite.c(6KB)
----bwtaln.c(11KB)
----QSufSort.h(2KB)
----bwase.c(19KB)
----rope.h(2KB)
----ChangeLog(123KB)
----is.c(7KB)
----main.c(4KB)