文件名称：Computational-Genomics:计算基因组学的Java智能项目，其中包含
文件大小：11KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-07 20:11:36
Java
计算基因组学软件 计算基因组学Java项目，其中包括：成对序列比对，系统发生和多序列比对。 成对序列比对 计算两个序列（DNA，RNA或蛋白质）的成对序列比对的程序。 •输入（用于输入参数的简单GUI）： 两个序列的文本字段（允许的字符az和AZ） 带有替换矩阵值的字段。例如：匹配2不匹配-1 indel -1.5间隙0•单选按钮以选择对齐算法：o整体对齐o末端空间*对齐o局部对齐o仿射间隙罚分模型对齐•按钮以启动算法。 •输出（带有对齐输出的GUI窗口）o成对对齐，显示所有匹配项，子项和插入/缺失。 o比对得分，匹配数，替换和插入缺失。
【文件预览】：
Computational-Genomics-main
----Pairwise sequence alignment()
--------OptimalAlignment.java(1KB)
--------EndSpaceFreeAlignment.java(4KB)
--------LocalAlignment.java(6KB)
--------GUI.java(29KB)
--------NeedlemanWunsch.java(4KB)
--------AffineGap.java(4KB)
----README.md(882B)