MicrO:在原核生物分类学描述中发现的表型和代谢特性,分析方法和培养基的微生物本体论

时间:2024-06-02 06:06:08
【文件属性】:

文件名称:MicrO:在原核生物分类学描述中发现的表型和代谢特性,分析方法和培养基的微生物本体论

文件大小:2.94MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-02 06:06:08

ontology microbiology phenomic bioinformatics-databases prokaryotic-taxonomic-descriptions

微 版本1.5.1b的原核表型和代谢特征的本体论(2018年6月14日发布)。 由Montana大学的Carrine E. Blank创建,2013年秋季至2016年Spring。共同撰稿人和顾问:Hong Cui(亚利桑那大学),Lisa Moore(南缅因大学)和Ramona Walls(亚利桑那大学)。 包括从> 3,000个原核生物分类描述中提取的术语和术语同义词,这些描述是从古细菌,蓝细菌,拟杆菌,硬毛虫和Mollicutes的大量分类描述中收集的。 开发本体和同义词列表是为了促进使用自然语言处理算法(MicroPIE)从原核生物分类描述中自动提取表型数据和字符状态。 MicroPIE是由Hon​​g Cui,Elvis Hsin-Hui-Hui Wu和Jin Mao(亚利桑那大学)与Carrine E. Blank(蒙大纳大学)和Lisa R.Moore(麦格理大学)合作


【文件预览】:
MicrO-master
----README.md(3KB)
----MicrOandImportModules()
--------CL_imports.owl(327KB)
--------PATO_imports.owl(1.37MB)
--------IDO_imports.owl(75KB)
--------REO_imports.owl(13KB)
--------ENVO_imports.owl(2.16MB)
--------MicrO.owl(9.85MB)
--------GO_imports.owl(943KB)
--------BSPO_imports.owl(126KB)
--------NDF-RT_imports.owl(47KB)
--------NCBITax_imports.owl(628KB)
--------DRON_imports.owl(11KB)
--------IAO_imports.owl(3KB)
--------OBI_imports.owl(45KB)
--------BFO_imports.owl(24KB)
--------RO_imports.owl(115KB)
--------FMA_imports.owl(6KB)
--------PR_imports.owl(8KB)
--------CHMO_imports.owl(100KB)
--------Uberon_imports.owl(299KB)
--------PO_imports.owl(43KB)
--------ChEBI_imports.owl(18.04MB)
----RecentUpdates(6KB)
----CuratorNotes(4KB)
----License(1KB)
----TasksRemaining(1KB)

网友评论