文件名称：QueryPathways：查找微生物和/或代谢物查询的所有途径
文件大小：16KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-05 08:49:54
Python
查询路径 语言：Python 输入：TXT 输出：TXT 经过测试：PluMA 1.1，Python 3.6 PluMA插件可从PathwayTools数据库中查询React（Karp等，2015）以获取分类和/或代谢物。 它以TXT格式返回路径。 输入是制表符分隔的关键字/值对的参数TXT文件：路径：来自PathwayTools查询的路径的TXT文件：查询的TXT文件 查询输入文件应包含一两行。 一个简单的分类单元或代谢物查找就是一条线。 要查询特定分类群，分类群/代谢物或代谢物对的所有React，请在单独的行中同时提供两者。 注意：示例文件夹包含此查询文件和参数TXT文件，但不包含路径文件，因为其中包含来自PathwayTools数据库的信息。 但是，如果您安装了PathwayTools，则“ PathwayTools”插件（ ）将为该路径生成此TXT文件。
【文件预览】：
QueryPathways-master
----example()
--------config.txt(107B)
--------pathwayinfo2.txt(67KB)
--------query.txt(18B)
--------parameters.txt(106B)
--------results.txt.expected(2KB)
----QueryPathwaysPlugin.py(2KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(944B)