文件名称：matlab加颜色代码-Novelty_analysis:Matlab和Python代码进行新颖性探索行为分析
文件大小：63KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-11 07:58:19
系统开源
matlab加颜色代码新颖性分析 Matlab和Python代码用于在老鼠中进行新颖性探索行为分析。 在和之后使用。 DeepLabCut数据分析脚本 基本数据分析 首先，运行DeepLabCut，请参阅 之后， 编辑配置文件 Config_NovAna.m 特别是，请确保使用正确的networkname_format ，它是“ DeepLabCut”之后的网络名称，不带扩展名。 例如DeepCut_resnet50_MoSeqNoveltySep12shuffle1_1030000 确保使用正确的videoname_format （视频的示例文件名），包括扩展名“ .mp4”或“ .avi”。 例如， C4_180907_rgb.mp4 您需要直接在包含所有视频和.csv文件的文件夹下运行以下代码，如果将视频放置在子文件夹下，请使用： MoveFromDir.m 要手动标记竞技场和物体的位置，请使用 MarkObjPos.m 计算头部位置，速度，角度等。还绘制轨迹，热图等。 Analysis.m 制作带标签的视频，以检查标签是否正确。 该脚本生成带有侧栏的带标签的视频，其中显示了帧号
【文件预览】：
Novelty_analysis-master
----MarkObjPos.m(2KB)
----Config_NovAna(ROTJ).m(715B)
----VideoLabeling.m(5KB)
----ConvertOldMat.m(610B)
----BatchAnalysisDLC.m(412B)
----MoveFromDir.m(797B)
----MoSeqAnalysis()
--------MoSeqSyllableClustering.m(756B)
--------MoSeqEventAlignedAnalysis.m(8KB)
--------MoSeqShuffling.m(5KB)
--------MoSeqMoveRGB.m(2KB)
--------MoSeqSyllableDisToObj.m(3KB)
--------MoSeqGeneralSyllableAnalysis.m(11KB)
--------MoSeqVideoLabeling.m(5KB)
--------Mice_Index_Template.m(6KB)
--------MoSeqDataPreProcess.m(226B)
--------MoSeqInterestingNodeTransition.m(8KB)
--------MoSeqFP_Dis.m(5KB)
--------MoSeqSynTest.m(1KB)
--------MoSeqSyllablePos.m(2KB)
--------MoSeqFP_VideoLabeling.m(1KB)
--------MoSeqEventBasedAnalysis.m(7KB)
--------MoSeqFP_raster.m(7KB)
--------MoSeqFP_Video.m(6KB)
--------FPDataTransfer.py(456B)
--------MoSeqSyllableUsageStatisticalAnalysis.m(6KB)
--------ModelDataTransfer.py(2KB)
--------Shell_Script_Template.sh(3KB)
--------MoSeqFP.m(2KB)
--------MoSeqGeneralTransition.m(7KB)
--------MoSeqSyllableLength.m(2KB)
----Analysis.m(8KB)
----Docs()
--------Using_DLC_in_UchidaLab_Mitsuko.md(2KB)
--------MoSeq_Example_Command.md(5KB)
--------Training_a_new_network.md(2KB)
--------Using_DLC_in_UchidaLab_Sara&Eva.md(2KB)
--------Using_DLC_in_UchidaLab_Korleki.md(2KB)
----Convert_Video.m(748B)
----README.md(8KB)
----Load_FP_Data.m(589B)
----Config_NovAna.m(756B)
----FurtherAnalysis()
--------TimeStatistic.m(2KB)
--------Plot_compare.m(4KB)
--------EnterCounts.m(1KB)
--------Periodogram.m(131B)
--------EventBasedAnalysis.m(22KB)
--------VideoLabelingNSB.m(4KB)
--------FindingPokeDTW.m(4KB)
--------Diff.m(813B)
--------Calculate_time.m(553B)
--------DistHistPerUnitArea.m(7KB)