PathAIA:数字病理分析工具

时间:2024-05-02 12:33:16
【文件属性】:

文件名称:PathAIA:数字病理分析工具

文件大小:51KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-02 12:33:16

Python

病原体 简单的数字语系分析工具。 •••• PathAIA旨在标准化和自动化数字病理学中的大多数WSI分析 如果您觉得在处理整个幻灯片图像时不断重复重写相同的代码,并且希望有一个很好的集成库来自动完成所有这些操作,那么您来对地方了。 借助PathAIA,我们的目标是创建一个快速,高级且模块化的库,以便大规模地在WSI上工作,以执行图像分析或为您的机器学习项目创建全面的数据集。 基本用法 步骤0:安装 从PyPI轻松安装 pip install pathaia 步骤1:导入Pathaia的补丁提取工具 from pathaia . patches import patchify_folder_hierarchically 步骤2:定义您的提取参数 您可以提取多个金字塔级别,并在不同级别的补丁之间使用分层结构进行提取。 您可以控制几乎每个喜欢的提取参数,从补丁大小到补丁或过滤器之间的间隔,


【文件预览】:
PathAIA-master
----.gitignore(1KB)
----README.md(5KB)
----.github()
--------workflows()
----test()
--------test_patches.py(3KB)
--------__init__.py(0B)
--------data.py(18KB)
----pathaia()
--------patches()
--------semantic()
--------__init__.py(0B)
--------deep()
--------util()
----LICENSE(34KB)
----setup.py(824B)
----doc()
--------make.bat(799B)
--------source()
--------template()
--------requirements.txt(25B)
--------Makefile(638B)
----tox.ini(549B)

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