【文件属性】：
文件名称：ABS-Scan:丙氨酸结合位点扫描诱变评估结合位点单个残基对小分子配体识别的贡献
文件大小：2.24MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-07-12 21:54:34
Python
ABS扫描
丙氨酸结合位点扫描诱变，用于评估结合位点的单个残基对小分子配体识别的贡献。
网络服务器
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单击此处可以查看示例输出 -
命令行使用
./alanine_scanning.py -h usage: alanine_scanning.py [-h] [-f PDBFILE] [-n RESNO] [-d DIST] [-o OUTDIR] 参数： -h, --help show this help message and exit
-f PDBFILE PDB file of protein-ligand complex
-n RESNO residue number of HETATM in protein-ligand complex
-d DIST distane-cutoff to use fo
【文件预览】：
ABS-Scan-master
----1a4g_A.pdb(218KB)
----rosetta_dock.sh(3KB)
----README.md(2KB)
----alanine_scanning_v2.py(27KB)
----alanine_scanning.py(25KB)
----test()
--------1a4g_A_ASN_293_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_GLU_116_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_GLU_225_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_ARG_149_ALA.pdbqt(291KB)
--------1a4g_A_ALA_244_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_ARG_373_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_ARG_153_ALA.pdbqt(291KB)
--------1a4g_A_ILE_220_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_GLU_274_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_ligand.pdbqt(2KB)
--------1a4g_A_GLU_275_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_binding_site.pdb(13KB)
--------1a4g_A_ARG_373_ALA.pdbqt(291KB)
--------1a4g_A_ALA_244_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_ARG_291_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_receptor.pdb(199KB)
--------1a4g_A_GLU_116_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_TYR_408_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_receptor.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_GLU_275_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_TRP_176_ALA.pdbqt(291KB)
--------1a4g_A_ARG_149_ALA.pdb(234KB)
--------Alanine_Scanning_Binding_Energies_Result.txt(2KB)
--------1a4g_A_ARG_115_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_TYR_408_ALA.pdbqt(291KB)
--------1a4g_A_ligand.pdb(3KB)
--------1a4g_A_ARG_153_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_ILE_220_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_ASN_293_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_GLU_274_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_ASP_148_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_GLU_225_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_TRP_176_ALA.pdb(234KB)
--------1a4g_A_ASP_148_ALA.pdbqt(292KB)
--------1a4g_A_ARG_115_ALA.pdbqt(291KB)
--------1a4g_A_ARG_291_ALA.pdbqt(291KB)