文件名称:smam:用于动物运动统计建模的R包
文件大小:336KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-07 19:43:04
hidden-markov-model animal-movement measurement-error hidden-states brownian-motion
自述文件 该自述文件通常会记录使该应用程序启动和运行所需的任何步骤。 这个R包是做什么用的? 此软件包提供了R中的动物运动的统计模型。统计模型提供了参考。 它们是具有嵌入式布朗运动^ [1,2]的动静模型,具有嵌入式布朗运动^ [3]的动静处理模型,具有测量误差^ [4]的布朗运动,具有测量误差的动静模型^ [5]。 此包装的快速指南以包装插图的形式提供。 版本:0.5.4.9000 如何设置? 运行以下R代码。 ## install.packages("devtools") devtools::install_github("ChaoranHu/smam") 或者 install.packages("smam") 注意:第一种方式需要您的计算机具有开发工具,但是可以帮助您遵循我github上的最新版本。 该软件包包括Cpp和C代码,因此您需要CPP编译器(对于Mac,您可以使用
【文件预览】:
smam-master
----vignettes()
--------quick_guide.pdf(160KB)
--------quick_guide.pdf.asis(74B)
----NAMESPACE(1KB)
----CRAN-RELEASE(126B)
----NEWS.md(2KB)
----cran-comments.md(723B)
----DESCRIPTION(1KB)
----src()
--------thmam_likelihood.cpp(53KB)
--------thmam_likelihood.h(3KB)
--------MRME_approx.cpp(18KB)
--------MRME.cpp(19KB)
--------Makevars.win(331B)
--------altb.c(3KB)
--------RcppExports.cpp(146KB)
--------state_path.cpp(12KB)
--------registerDynamicSymbol.c(229B)
--------.gitignore(15B)
--------movres-llk.cpp(22KB)
--------movres.h(802B)
--------movmov-llk.cpp(10KB)
--------Makevars.in(280B)
----inst()
--------CITATION(5KB)
--------src_vign()
--------include()
----R()
--------state_mrh.R(5KB)
--------seasonalFit.R(16KB)
--------fitMovResHan.R(10KB)
--------seasonalTools.R(5KB)
--------bmme.R(11KB)
--------data.R(510B)
--------movmov.R(9KB)
--------movres.R(59KB)
--------state_mr.R(7KB)
--------zzz.R(76B)
--------smam.R(680B)
--------RcppExports.R(11KB)
--------rMovResHan.R(7KB)
----configure(83KB)
----.travis.yml(236B)
----.Rbuildignore(220B)
----LICENSE(34KB)
----COPYRIGHT(875B)
----README.md(3KB)
----Makefile(2KB)
----configure.ac(865B)
----data()
--------f109.RData(41KB)
----man()
--------approxNormalOrder.Rd(1KB)
--------rMM.Rd(2KB)
--------transfData.Rd(2KB)
--------fitMR.Rd(4KB)
--------rMR.Rd(2KB)
--------fitMM.Rd(3KB)
--------rBMME.Rd(1KB)
--------seasonFilter.Rd(932B)
--------smam.Rd(611B)
--------f109.Rd(637B)
--------fitMRME.Rd(4KB)
--------rMRH.Rd(2KB)
--------integr.control.Rd(822B)
--------fitStateMRH.Rd(3KB)
--------dtm.Rd(2KB)
--------estVarMRME_Godambe.Rd(3KB)
--------fitMRH.Rd(3KB)
--------fitBMME.Rd(3KB)
--------fitStateMR.Rd(3KB)
----.gitignore(53B)
----cleanup(30B)