文件名称：piper-nf:RNA作图管道
文件大小：62.03MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-04 09:03:22
pipeline nextflow Nextflow
派珀R NF 用于检测和定位长非编码RNA的管道 快速开始 确保您已在上一节中列出了所有必需的依赖项。 通过运行以下命令来安装Nextflow运行时： $ curl -fsSL get.nextflow.io | bash 完成后，您可以通过输入以下所示的命令来启动管道执行： $ ./nextflow run cbcrg/piper-nf 默认情况下，对提供的示例数据集执行管道。 检查下面的“管道参数”部分，以了解如何在程序命令行上指定输入数据。 管道参数 询问 多记录格式的查询成绩单文件 示例： nextflow run piper-nf --query=/some/path/query.fa 基因组文件 该文件列出了基因组文件的完整路径 示例： nextflow run piper-nf --genomes-file=my-genomes.txt 基因组数据库 BLAST格
【文件预览】：
piper-nf-master
----.gitignore(54B)
----Dockerfile(2KB)
----nextflow.config(113B)
----nextflow(9KB)
----piper_1.1.nf(19KB)
----.dockerignore(112B)
----bin()
--------repeat.pl(2KB)
--------x-blast.sh(523B)
--------exonerateRemapping.pl(36KB)
--------x-format.sh(455B)
--------sim2matrix.pl(4KB)
----.travis.yml(279B)
----cloud-boot.sh(1KB)
----Vagrantfile(5KB)
----COPYING(34KB)
----README.md(4KB)
----circle.yml(206B)
----piper_std.nf(14KB)
----tutorial()
--------genomes()
--------5_RNA_queries.fa(1KB)
----validate.sh(2KB)
----bootstrap.sh(2KB)
----nextflow.config_example(131B)
----piper.nf(18KB)