文件名称：用于 GWAS 结果可视化的曼哈顿图：用于在 MATLAB 中直接从来自 PLINK、BOLT-LMM 或 SAIGE 的 GWAS 统计数据的文本文件绘制曼哈顿图的函数-matlab开发
文件大小：4KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-18 01:59:43
matlab
此函数采用 PLINK 1.7 assoc 命令、BOLT-LMM 或 SAIGE 关联测试的输出，生成可用于发布的曼哈顿图，并将结果保存为 .fig 以供手动调整和高分辨率 .png。 该功能已在 PLINK 中使用 .assoc、.assoc.fisher 和 .assoc.logistic 文件扩展名进行了测试。 由于此函数从输出文件中读取标题行，因此必须包含它。 对于输出文件大小可以达到几 GB 的估算数据上的非常大的 GWAS，我建议在将文件传递到 ManhattanPlot 之前删除 p>0.1 或 0.01 的 SNP。 此函数对于使用来自 MATLAB 背景的 GWAS 数据的生物信息学家很有用。 参数 'sex' 可以设置为 0 或 1 以指定是否应绘制性染色体，'sig' 指定水平线的全基因组显着性阈值。 使用带有选项 PLINK、BOLT-LMM 和 SAIGE
【文件预览】：
ManhattanPlot.m.zip