文件名称：matlab简单图像处理代码-medical-imaging-pipelines:用于构建医学和神经科学成像数据的数据预处理和分析管道的工具
文件大小：24KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 10:30:41
系统开源
matlab简单图像处理代码医学影像管道 该代码为构建用于医学图像处理任务的管道提供了一个简单的框架。 要求 要使用基本的管道构建代码，需要使用。 使用当前可用的图像注册工具需要图像注册工具箱。 使用MATLAB编译的命令（MCC）需要使用。 入门 有关示例，请参见regpipe.py ，该文件实现了本文中描述的注册管道： 大型多模式临床影像研究的量化和分析：Sridharan等人在卒中中的应用。 要构建自己的管道，可以将此脚本用作基线或构建自己的管道。 按照您希望它们执行的顺序从pipebuild.py创建Command对象，就像使用shell脚本一样。 最后，使用Command.generate_code()将Shell脚本写入文件。 您可以在python中使用子regpipe.py ，使用regpipe.py带有SGE的集群或使用您喜欢的任何其他方法来运行此文件。 档案结构 文件结构由pipebuild.py的Dataset类pipebuild.py 。 该代码当前是基于假设只有一个图集图像而构建的，但是在以后的更新中将对此进行概括。 文件根据Dataset的get_file
【文件预览】：
medical-imaging-pipelines-master
----qsub-run(17KB)
----regpipe.py(13KB)
----strip_header.py(2KB)
----tracking.py(4KB)
----LICENSE(1KB)
----matchWM.py(2KB)
----padNii.py(2KB)
----.gitignore(6B)
----pipebuild.py(24KB)
----README.md(2KB)