文件名称：scGEAToolbox:用于单细胞 RNA-seq 数据分析的 Matlab 工具箱-matlab开发
文件大小：164.76MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-20 03:57:49
matlab
单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 技术彻底改变了生物医学科学研究的方式。 它为研究细胞异质性和基因表达变异性提供了前所未有的单个细胞分辨率水平。 然而，由于数据的稀疏性和高维度，分析 scRNA-seq 数据具有挑战性。 我开发了 scGEAToolbox——一个用于 scRNA-seq 数据分析的 Matlab 工具箱。 它包含用于数据归一化、特征选择、批量校正、插补、细胞聚类、轨迹/伪时间分析和网络构建的一整套功能，可以组合和集成来构建自定义工作流。 虽然大多数功能是在本机Matlab中实现的，但提供了包装器功能，使用户可以调用以Matlab或其他语言开发的“第三方”工具。 此外，scGEAToolbox 配备了由 App Designer 生成的复杂图形用户界面 (GUI)，使其成为用于快速数据处理的易于使用的应用程序。
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