文件名称:OLGenie:估计重叠基因(OLG)中的dNdS的程序
文件大小:854KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-26 12:04:31
perl selection overlapping dnds-estimation molecular-evolution
OLGenie:估计重叠基因(OLG)中的dNdS的程序
【文件预览】:
OLGenie-master
----.gitignore(617B)
----supplementary_scripts()
--------process_alignment_simple.R(3KB)
--------sliding_windows.R(10KB)
--------simulation_sas13.pl(46KB)
--------simulation_ss13.pl(44KB)
--------process_alignment.R(5KB)
--------simulation_sas12.pl(47KB)
--------simulation_sas11.pl(47KB)
--------xml2fasta.R(4KB)
--------controls.R(7KB)
----OLGenie_bootstrap.R(17KB)
----LICENSE(34KB)
----OLGenie.pl(194KB)
----OLGenie_sliding_windows.R(21KB)
----EXAMPLE_OUTPUT()
--------example3.out(1KB)
--------example2.out(2KB)
--------example1.out(2KB)
--------OLGenie_codon_results.txt(102KB)
--------OLGenie_codon_results_ex2.txt(165KB)
----README.md(30KB)
----sas12_figure.png(117KB)
----OLGs_all_frames.png(332KB)
----OLGenie_logo.png(447KB)
----EXAMPLE_INPUT()
--------HIV1_env_BLAST.fa(89KB)