文件名称:matlab图片叠加的代码-SemiSeg:微观视频数据的半自动分段代码。为小鼠的宽视野荧光钙成像数据创建
文件大小:13KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 13:40:49
系统开源
matlab图片叠加的代码半段 微观视频数据的半自动分段代码。 为宽场荧光钙成像数据创建,格式为鼠标中的tiff堆栈。 没什么新奇的东西可以使用,因为在商业包装中使用了许多技术,但是我需要一些可以在需要时根据需要进行更改的东西。 我经常使用此代码来生成细分项目的“真实”值,因为我通过该代码获得了动态反馈,并对作为真实输出的结果有自己的确定性。 使用内置的matlab函数来浏览图像并选择在图像的各种处理版本上设置阈值的感兴趣区域(ROI),如下所述。 原始图像-阈值由整个视频堆栈的最大/最小投影确定。 这是显示的标准图像。 互相关图像-阈值是根据跨时间的像素级互相关确定的,以用于放大图像选择,以加快处理速度并允许对大/高分辨率视频文件进行此计算。 主成分分析-阈值是针对放大图像选择中时间迹线的前3个主要成分独立确定的。 将为那些组件中的任何一个组件的百分比阈值之上的所有值创建ROI,然后将其合并为一个ROI。 功能说明 loadTifArray_Multifile-使用“ LoadTifArray_Multifile.m”将tif文件加载到内存中。 该文件的输入是要对图像进行二次采样的帧
【文件预览】:
SemiSeg-master
----SemiSeg.m(28KB)
----SemiSeg_Remove.m(3KB)
----SemiSeg_Label.m(3KB)
----LICENSE(11KB)
----README.md(3KB)
----shiftROIs.m(748B)
----loadTifArray_Multifile.m(2KB)