文件名称：内点法matlab代码-OASIS:钙成像数据反卷积
文件大小：1.12MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 11:51:00
系统开源
内点法matlab代码OASIS：钙成像数据的在线快速反卷积 从荧光钙成像数据中提取神经活动的工具 该代码可以很容易地在神经时间荧光钙成像数据上运行。 请看一下。 要求 该脚本已在Linux和MacOS（一些用户也成功使用Windows）上使用典型的数值/科学Python 2.7或3.5-3.8安装程序进行了测试，例如使用Anaconda或Canopy，其中包括以下内容： python> = 2.7.11 matplotlib> = 1.5.1 numpy的> = 1.10.2 scipy> = 0.16.1 cython> = 0.23.4 可选地，由于不需要对您自己的数据运行我们的快速方法，因此，我们进一步安装了以下内容以与内部点方法进行比较 cvxpy> = 0.3.6 古罗比> = 6.5.0（，免费学术许可证） mosek> = 7（免费学术许可证） 安装 为了更快地执行，一些功能已用Cython编写，需要通过运行以下命令进行编译： python setup.py build_ext --inplace （忽略有关Cython正在使用不推荐使用的Numpy API的警告。暂时
【文件预览】：
OASIS-master
----test_requirements.txt(4B)
----requirements.txt(22B)
----examples()
--------fig5.py(3KB)
--------PAVA.mp4(105KB)
--------fig3.py(9KB)
--------table1.py(3KB)
--------fig2.py(6KB)
--------fig4.py(11KB)
--------Demo.ipynb(963KB)
--------fig6.py(6KB)
--------fig1.py(1KB)
--------video.mp4(274KB)
----.travis.yml(721B)
----LICENSE(34KB)
----setup.py(1KB)
----README.md(3KB)
----oasis()
--------functions.py(33KB)
--------__init__.py(142B)
--------plotting.py(759B)
--------oasis_methods.pyx(56KB)
----tests()
--------test_deconvolution.py(2KB)
----.gitignore(113B)