RPCT:基于RAAC-PSSM的蛋白质分类预测工具包

时间:2024-04-19 03:39:18
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文件名称:RPCT:基于RAAC-PSSM的蛋白质分类预测工具包

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更新时间:2024-04-19 03:39:18

Python

PCT 基于RAAC-PSSM的蛋白质分类预测工具包 介绍 RPCT工具箱是基于RAAC-PSSM蛋白分类预测方法的专用工具箱。 它使用7种特征提取方法和SVM进行蛋白质分类预测。 快速开始 RPCT软件包是用Python编写的。 建议使用来管理python软件包。 或者,请确保以下所有软件包均已安装在其Python环境中:ray,sklearn,blast。 # install packages by conda conda install package_name # install blast+ by conda conda install -c bioconda blast 请将数据转换为FASTA格式。 RPCT工具包同时支持Windows和Linux平台。 在运行RPCT之前,应检查命令。 通过Windows运行RPCT python RPCT_windows.py 在


【文件预览】:
RPCT-main
----RPCT_linux.py(13KB)
----rpct()
--------Fuction_win.py(5KB)
--------Multprocess.py(3KB)
--------libsvm-3.24()
--------aaindexDB()
--------RocMP.py(18KB)
--------Ray_blast.py(988B)
--------ReadBE.py(25KB)
--------raacDB()
--------README(3KB)
--------bin()
--------Ray_blast_win.py(1KB)
--------TrainFP.py(28KB)
----README.md(8KB)
----RPCT_windows.py(46KB)

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