cpfp:比较蛋白质功能预测——处理DSSP数据的Java工具包

时间:2024-07-19 03:18:45
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文件名称:cpfp:比较蛋白质功能预测——处理DSSP数据的Java工具包

文件大小:727KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-19 03:18:45

Java

CPFP 比较蛋白质功能预测——一个处理数据的java工具包 有数以千计的蛋白质结构。 提供有关 PDB 中每条链的蛋白质主链的二级结构信息。 该算法将七个结构元素之一分配给每个氨基酸。 这些结构元素是: H = α-螺旋 B = 分离的 β 桥中的残基 E = 延伸链,参与 β 阶梯 G = 3-螺旋(310 螺旋) I = 5 螺旋(π-螺旋) T = 氢键匝数 S = 弯曲 该项目旨在通过 java 工具包访问这些结构信息。 教程 外部代码 我们在项目中使用了这些第三方类: 用于在列表中选择项目的 用于快速双字符到字符串的转换 作者 卢斯 福格特


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