文件名称：eSIR:扩展状态空间SIR流行病学模型
文件大小：47.09MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-04 11:29:54
R
R包eSIR：扩展的状态空间SIR流行病学模型 2020-06-05 注意事项： 从0.3.1版开始，我们添加了美国数据。 最近的更新是在9月3日。 我们使用了来自和数据摘要。 只有41个州拥有完整的恢复数据。 我们将在每个星期四或星期五晚上更新数据。 对数据使用以下代码： data( " confirmed " ) # From JHU CSSE data( " death " ) # From JHU CSSE data( " recovered " ) # partly from 1Point3Acres data( " USA_state_N " ) # population in each state 自从0.3.3版本中，我们使用添加格尔曼-鲁宾统计收敛检查从 。 它们的值实质上大于1表示MCMC链收敛失败。 通过设置save_files = TRUE将其保存在.txt
【文件预览】：
eSIR-master
----.gitignore(40B)
----NAMESPACE(292B)
----R()
--------tvt.eSIR.R(43KB)
--------qh.eSIR.R(47KB)
--------eSIR.R(240B)
--------eSAIR.R(46KB)
--------utils.R(233B)
----data()
--------recovered.rda(29KB)
--------confirmed.rda(43KB)
--------death.rda(31KB)
--------USA_state_N.rda(894B)
----eSIR.Rproj(396B)
----Hubei_q_Gelman_diag.txt(934B)
----.Rbuildignore(97B)
----LICENSE.md(18KB)
----eSIR.pdf(157KB)
----man()
--------qh.eSIR.Rd(10KB)
--------eSAIR.Rd(10KB)
--------tvt.eSIR.Rd(10KB)
--------figures()
----install_pkg()
--------eSIR_0.3.2.tgz(2.23MB)
--------eSIR_0.2.7.tgz(2.01MB)
--------eSIR_0.3.3.tar.gz(10.12MB)
--------eSIR_0.2.6.tgz(1.95MB)
--------eSIR_0.3.0.tar.gz(6.15MB)
--------eSIR_0.3.1.tgz(2.23MB)
--------eSIR_0.2.5.tgz(2MB)
--------eSIR_0.3.1.tar.gz(5.82MB)
--------eSIR_0.3.3.tgz(2.23MB)
--------eSIR_0.3.0.tgz(2.12MB)
--------eSIR_0.2.8.tgz(2.01MB)
--------eSIR_0.3.2.tar.gz(5.82MB)
----README.md(17KB)
----README_cn.md(11KB)
----README.Rmd(15KB)
----Hubei_step_Gelman_diag.txt(796B)
----DESCRIPTION(1KB)
----Hubei_exp_Gelman_diag.txt(796B)