biopython中文文档

时间:2022-04-29 16:52:47
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文件名称:biopython中文文档

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文件格式:PDF

更新时间:2022-04-29 16:52:47

生信 bio python

Biopython 工程是一个使用Python 来开发计算分子生物学工具的国际团体。(http://www.python.org) Python 是一种面向对象的、解释型的、灵活的语言,在计算机科学中日益流行。Python 易学,语法明晰, 并且能很容易的使用以C,C++ 或者FORTRAN 编写的模块实现扩展。 Biopython 官网(http://www.biopython.org) 为使用和研究生物信息学的开发者提供了一个在线的资源 库,包括模块、脚本以及一些基于Python 的软件的网站链接。一般来讲,Biopython 致力于通过创造高 质量的和可重复利用的模块及类,从而使得Python 在生物信息学中的应用变得更加容易。Biopython 的 特点包括解析各种生物信息学格式的文件(BLAST,Clustalw,FASTA,Genbank...),访问在线的服务器 (NCBI,Expasy...),常见和不那么常见程序的接口(Clustalw,DSSP,MSMS...),标准的序列类,各种收 集的模块,KD 树数据结构等等,还有一些文档。 基本来说,我们喜欢使用Python 来编程,并且希望通过创建高质量、可复用的模块和脚本来使得 Python 在生物信息学中的应用变得容易。


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