GenBank Flat File Reader:将 GenBank 格式的平面文件读入结构-matlab开发

时间:2021-05-30 08:31:03
【文件属性】:
文件名称:GenBank Flat File Reader:将 GenBank 格式的平面文件读入结构-matlab开发
文件大小:5KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-30 08:31:03
matlab 尽管 MATLAB 生物信息学工具箱具有内生 GenBank 文件读取器 genbankread(),但有时难以读取这些具有意外但并非非正统格式的平面文件。 该程序 gbread() 旨在用更通用的替代方案替换 genbankread()。 与期望字段保持严格格式和顺序的 genbankread() 不同,gbread() 将每条记录作为文本行的元胞数组阻止,搜索字段,并使用 switch/case 设计处理它们。 未识别的字段不会引起致命错误,而是作为文本块附加到输出结构中。 基准测试显示,与 genbankread() 相比,gbread() 的速度惊人地提高了 10 倍。 与 genbankread() 不同,gbread() 默认自动解析功能,但在关闭此选项时不会牺牲读取 CDS 条目的时间。 总体而言,gbread() 为在 MATLAB 中读取 GenBank 平面文件提供了增
【文件预览】:
gbread.zip

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