CellECT:细胞ECT

时间:2024-05-20 05:45:18
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更新时间:2024-05-20 05:45:18

Python

CellECT:细胞进化捕获工具 关于 CellECT是在3D共聚焦显微镜膜体积中进行细胞分析的工具。 CellECT提供了一种分割工具,该工具可以在体积上运行种子分水岭,预测不确定区域,并允许用户与分割进行交互以进行校正。 CellECT还提供了一种分析工具,可以按时间序列量化单元格上的图案。 示范影片 安装 CellECT支持Linux和MacOS,并已在Ubuntu 11.10,Ubuntu 12.04和Fedora 18上进行了测试。 先决条件: python 2.7 numpy 1.6.1 scipy 0.10.0 python图像 matplotlib 1.1.1或更高版本 pyml 0.7.10(和libsvm) 术语颜色 pylibtiff(和libtiff) Qt的pyside包装器 opencv python包装器 Matlab(imimposemin所需


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