文件名称：microRNA-sequencing:创建用于microRNA测序管道的存储库
文件大小：55KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-09 04:40:32
R
=================== microRNA测序 创建用于microRNA测序分析管道的存储库 存储库包含所有用于microRNA测序数据分析的自定义linux bash脚本，perl脚本和R脚本。 为了使用提供的管道和脚本，用户应首先参考miRNA-seq_QC_filter.txt文件，该文件将导致其他各种脚本。 以后可能会为每个脚本添加更多的README文件，以便于用户使用和理解。 有关我们的文章或资源库的任何查询，请联系： 卡罗莱纳州 或者 Correia， 或者 麦克休（德国） DOI徽章： ：
【文件预览】：
microRNA-sequencing-master
----Linux_bash_scripts()
--------Novoalign-featureCounts.txt(11KB)
--------Sequencing_depth_pipeline.txt(8KB)
--------miRdeep-star.txt(4KB)
--------miRNA-seq_QC_filter.txt(12KB)
--------miRdeep2.txt(5KB)
----Perl_scripts()
--------Get_isomiR_count.pl(21KB)
--------Fasta_keep_value.pl(3KB)
--------miRNA_info_grepping.pl(5KB)
--------Fasta_ignore_value.pl(3KB)
--------gff2gtf.pl(2KB)
----.gitattributes(378B)
----R_scripts()
--------General_function.R(24KB)
--------miRNAseq_isomiR_edgeR_pipeline.R(30KB)
--------RT-qPCR_DE_pipeline.R(10KB)
--------miRNAseq_edgeR_pipeline.R(38KB)
----README.md(809B)
----License.md(18KB)