pubmed_pa​​rser:用于PubMed开放访问XML子集和MEDLINE XML数据集的Python解析器

时间:2024-02-24 12:11:04
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文件名称:pubmed_pa​​rser:用于PubMed开放访问XML子集和MEDLINE XML数据集的Python解析器

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更新时间:2024-02-24 12:11:04

python nlp parse article xml

Pubmed解析器:用于PubMed Open-Access XML子集和MEDLINE XML数据集的Python解析器 Pubmed Parser是一个Python库,用于解析, 存储库和 。 它使用lxml库将该信息解析为Python字典,该字典可轻松用于研究,例如在文本挖掘和自然语言处理管道中。 有关可用的API和有关数据集的详细信息,请参阅我们的或以获取更多详细信息。 下面,我们列出了一些核心功能和代码示例。 可用的解析器 path提供给函数可以是路径的压缩或解压缩的XML文件。 我们在文件夹中提供示例文件。 对于网站解析,您应该暂停一下。 请参阅因为如果您尝试批量下载,您的I


【文件预览】:
pubmed_parser-master
----setup.py(2KB)
----.gitignore(2KB)
----pubmed_parser()
--------pubmed_web_parser.py(13KB)
--------__init__.py(561B)
--------utils.py(4KB)
--------pubmed_oa_parser.py(18KB)
--------medline_parser.py(22KB)
----requirements.txt(51B)
----data()
--------1472-6831-8-11.nxml(59KB)
--------pone.0046493.nxml(115KB)
--------pntd.0002065.nxml(81KB)
--------pmids.txt(78B)
--------pone.0000217.nxml(73KB)
--------ehp-116-1694.nxml(84KB)
--------6605965a.nxml(89KB)
--------mds526.nxml(106KB)
--------pubmed20n0014.xml.gz(15.88MB)
--------1471-2180-11-174.nxml(104KB)
----.travis.yml(707B)
----CONTRIBUTING.md(5KB)
----LICENSE(1KB)
----paper()
--------paper.bib(4KB)
--------paper.md(4KB)
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE()
----scripts()
--------utils.py(1KB)
--------README.md(1KB)
--------pubmed_oa_spark.py(5KB)
--------medline_spark.py(4KB)
----README.md(15KB)
----tests()
--------test_pubmed_oa_parser.py(2KB)
--------test_medline_parser.py(1KB)
----docs()
--------install.rst(760B)
--------spark.rst(2KB)
--------Makefile(634B)
--------api.rst(871B)
--------index.rst(2KB)
--------conf.py(2KB)
--------doc_requirements.txt(38B)
--------make.bat(795B)
--------README.md(263B)
--------resources.rst(3KB)

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