液晶合成器

时间:2024-03-16 00:48:22
【文件属性】:

文件名称:液晶合成器

文件大小:879KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-16 00:48:22

Python

液晶合成器 LCD-Composer是一个升ow-Çomplexity d omain COMPO sition小号卡恩ER设计蛋白质序列,在所描述来识别简单或多方面的低复杂度的结构域(LCD)的(Cascarina等人2020)。 注意:截至目前,该手稿目前正在同行评审中,尚不可用。 LCD-Composer通过使用定义大小的扫描窗口计算蛋白质序列中每个位置的氨基酸组成和氨基酸的线性扩散来识别LCD。 有关算法工作原理的完整说明(包括算法工作流程的图形表示和广泛的参数测试),请参见上面引用的出版物。 LCD-Composer在Python 3上运行,不需要任何外部依赖关系。 可以从下载最新版本的Python。 基本用法 $ python LCD-Composer.py Sequences_File结果_文件[-a AMINO_ACIDS] [-c组成] [-w WINDOW_SIZE


【文件预览】:
LCD-Composer-master
----LCD-Composer.py(24KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(11KB)
----EXAMPLES()
--------TestSequences.fasta(4KB)
--------README.md(1KB)
--------TestResults.zip(3KB)
----Reproducibility()
--------Viruses_Analyses()
--------Eukaryota_Analyses()
--------Archaea_Analyses()
--------README(5B)
--------Bacteria_Analyses()

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