文件名称：Needleman-Wunsch:Needleman-Wunsch算法的实现
文件大小：9KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-09 04:42:37
R
R中的Needleman-Wunsch 这是一个R包，用于实现Needleman和Wunsch序列比对，并使用testthat单元测试框架进行了单元测试。 安装： 使用devtools ： devtools::install_github("hiraethus/Needleman-Wunsch") 用法示例： > library( " hiraethus.needleman.wunsch " ) > sequence1 <- " ACCCGGTCGTCAATTA " > sequence2 <- " ACCACCGGTTGGTCCAATAA " # scoring scheme for the algorithm > match <- 1 > mismatch <- - 1 > gap <- - 1 > alignment <- needle( sequence1 , sequ
【文件预览】：
Needleman-Wunsch-master
----hiraethus.needleman.wunsch.Rproj(386B)
----NAMESPACE(109B)
----tests()
--------testthat()
--------testthat.R(54B)
----.Rbuildignore(28B)
----.gitignore(35B)
----R()
--------needle.R(3KB)
--------matching_function.R(406B)
--------generate_value_matrix.R(3KB)
----DESCRIPTION(474B)
----README.md(748B)