MATLAB图论分割代码-CorneaSegGraphs:CorneaSegGraphs

时间:2024-06-16 06:45:09
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文件名称:MATLAB图论分割代码-CorneaSegGraphs:CorneaSegGraphs

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更新时间:2024-06-16 06:45:09

系统开源

MATLAB图论分割代码自述文件 该存储库包含示例Matlab代码,用于使用图论对角膜层界面进行分割。 根据图像构造一个有向图,并添加两个辅助起点和终点。 细分被公式化为寻找stat和终端节点之间的最小成本路径。 所提出的方法是对正常和异常角膜光学相干断层扫描(OCT)图像(例如下图所示的OCT图像)进行分割的通用方法。 下图显示了OCT图像中三个角膜层界面的分割示例。 我提供了一个起始项目,该项目可以分割三个接口,但是其他接口也可以用相同的方式进行分割。 该代码背后的算法在以下论文中发布: 本文是开放存取的,因此您可以阅读本文以了解更多详细信息。 如果您通过以下引用使用了代码,请引用本文: Amr Elsawy,Giovanni Gregori,Taher Eleiwa,Mohamed Abdel-Mottaleb,Mohamed Abou Shousha; OCT图像中的病理角膜层分割和厚度测量。 反式可见科学科技2020; 9(11):24。 土井: 请注意,提供的OCT图像是使用Bioptegen OCT机器从我Amr Elsawy获得的。


【文件预览】:
CorneaSegGraphs-master
----helper functions()
--------layer_unflatten.m(440B)
--------dm_gradient.m(272B)
--------smooth.m(626B)
--------order_layers.m(127B)
--------locnorm.m(713B)
--------layer_roi.m(408B)
--------trim_gradient_edges.m(115B)
--------other_layer_roi.m(595B)
--------bw_gradient.m(366B)
--------search_layer.m(881B)
--------adjmat_directed_flat.m(3KB)
--------img_flatten.m(648B)
--------layer_direction.m(1KB)
--------adjmat.m(3KB)
--------localnormalize.m(796B)
--------get_features.m(338B)
--------smooth_layer.m(693B)
--------init_roi.m(711B)
--------segment_img.m(2KB)
--------st_gradient.m(345B)
--------init_gradient.m(774B)
--------adjmat_directed.m(4KB)
----segmentation.png(562KB)
----.DS_Store(6KB)
----LICENSE.md(242B)
----main_script.m(538B)
----README.md(2KB)
----elsawy_od.png(1.39MB)

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